Peintures de Boudin et des précurseurs de l'impressionnisme. Peintres de l'estuaire de la Seine.
La visite du musée s'articule autour de sept thèmes :
- la salle Désiré Louveau offre une riche collection ethnographique de costumes, accessoires, dentelles, mobilier, coiffes de Haute et de Basse-Normandie ;
- la salle consacrée à Driès, Gernez, Herbo, Saint-Delis et Bigot, cinq artistes ayant vécu et réalisé la plupart de leur œuvre à Honfleur ;
- la salle Katia Granoff, consacrée aux artistes du XXe siècle qui ont vécu ou travaillé à Honfleur et en Normandie, et les peintres de l'École de Rouen ;
- la chapelle, lieu des expositions temporaires au rythme de deux chaque année. En l'absence d'expositions temporaires, la chapelle permet la présentation, par roulement, des œuvres du musée en réserve ;
- Eugène Boudin et les peintres du XIXe siècle : dans une salle, les peintures exposées, évoluant du romantisme sombre d'E. Isabey vers la clarté lumineuse de C. Monet, évoquent l'atmosphère des rencontres à l'auberge Saint-Siméon. Les œuvres d'Eugène Boudin (plus d'une centaine) sont entourées par celles des peintres amis. Au fond de cette salle, deux espaces présentent les œuvres d'Eugène Boudin. Dans l'un sont regroupés les pastels : ciels, vues de Honfleur, scènes à l'auberge Saint-Siméon. Dans l'autre sont présentées les peintures à l'huile : plages, portraits, paysages et marines ;
- la donation Hambourg-Rachet restitue l'esprit d'une famille de trois générations d'amateurs et d'artistes ;
- le cabinet des dessins, qui offre la possibilité d'admirer une centaine d'oeuvres sur papier classées par thème.
Dans le clocher Sainte-Catherine sont présentées des œuvres religieuses : Sculptures, souvenirs de Notre-Dame de Grâce et des charités normandes.